Für den Befall mit Flöhen sind Frettchen genauso anfällig wie Hunde und Katzen. Betroffene Tiere leiden an Juckreiz, durch das Kratzen geht das Fell aus und es bilden sich Krusten. Außerdem kann im Fell dunkelbrauner bis rötlicher Flohkot zu sehen sein. Bei der Behandlung mit Insektiziden müssen dringend auch die Lagerstätten desinfiziert werden, da sich Flöhe auch in Textilien einnisten.

Ohrmilben sind eine bei Frettchen weit verbreitete Erkrankung und machen sich an einem bräunlichen bis schwarzen Sekret in den Ohrkanälen bemerkbar. Frettchen mit Ohrmilben schütteln auffallend häufig mit dem Kopf, halten diesen geneigt und kratzen sich an den Ohren. Ob es sich um Milben oder um eine Ohrentzündung handelt, lässt sich unter dem Mikroskop oder sogar mit dem bloßen Auge feststellen.

Frettchen können sich mit vielen Arten von Darmparasiten infizieren. Dazu gehören unter anderem Spulwürmer, Hakenwürmer, Bandwürmer und Kokzidien. Fast alle Darmwürmer können Durchfall, schleimigen oder blutigen Stuhl, einen aufgeblähten Bauch, Gewichtsverlust, Lethargie und sprödes Fell verursachen.

Wurmkuren sind in Form von Tabletten oder als Paste erhältlich. Wird das betroffene Tier mit anderen Frettchen, Hunden oder Katzen zusammengehalten, sollten auch diese entwurmt werden.